複雑性膀胱炎は複雑性尿路感染症の一部分症です。複雑性尿路感染症とは、解剖学的、機能的尿路異常（尿流の障害が起こる）、及び代謝的、免疫学的異常で、感染防御機能が低下している場合に起こるものです。高齢者では、前立腺肥大症、神経因性膀胱、膀胱癌などで起こる頻度が高いです。子供の場合は尿路の先天的異常が多いです。